Sebelum terbentuknya Desa Sebapo, wilayah ini awalnya pada tahun 1951 merupakan dua kampung, yang pertama Kampung Sebapo Marga Kumpeh Ulu dengan wilayahnya sebelah kiri jalan dari arah Kota Jambi, yang kedua Kampung Sebapo Marga Mestong dengan wilayahnya sebelah kanan dari arah Kota Jambi. Kampung Sebapo Marga Mestong dipimpin oleh Raden Perang, sedangkan Kampung Sebapo Marga Kumpeh Ulu dipimpin oleh Syamiun.

Sejalan dengan perjalanan waktu dan perkembangan zaman, maka pada tahun 1955 diresmikan Kampung Sosial Nagasari oleh Wakil Presiden saat itu H. M. Hatta, dimana untuk Kampung Sebapo Marga Mestong sejak tahun 1955 kepala Kampungnya dijabat oleh Mantri Sulaiman AM., di Kampung Sebapo Marga Kumpeh Ulu dan Marga Mestong ini mengalir tiga sungai yaitu sungai Sebapo di kilometer 21, sungai Lingkang di kilometer 22 dan sungai Ringkang di kilometer 23. Nama Kampung Sebapo berasal dari nama sungai Sebapo, nama tersebut berawal dari warga Muaro Medak yang menggunakan sungai Sebapo sebagai sarana transportasi, warga Muaro Medak keluar masuk ke Kota Jambi melalui sungai Sebapo tersebut yang tempatnya di kilometer 21.

Atas inisiatif Kepala Kampung Kumpeh Ulu (Syamiun) pada tahun 1963 diadakan musyawarah untuk mendirikan sebuah Sekolah Rakyat (SR), hasil musyawarah tersebut diajukan kepada Pesirah Kumpeh Ulu (Ibrhim Rudin) namun tidak memperoleh tanggapan, selanjutnya diajukan kepada Pesirah Marga Mestong (Chalik Sulaiman) barulah mendapatkan respon dengan syarat Syamiun tetap menjadi Kepala Kampung namun Marganya masuk Marga Mestong. Sejalan dengan perjalanan waktu setelah Kepala Kampung Sebapo (Syamiun) meninggal maka roda pemerintahan diserahkan kepada Mangku (Said Umar), akan tetapi roda pemerintahan diserahkan tidak berjalan sebagaimana yang diharapkan, sehingga akhirnya kedua Kampung tersebut digabung menjadi satu Kampung yaitu Kampung Sebapo. Pada tahun 1984 nama Kampung Sebapo menjadi Desa Sebapo dan masuk dalam wilayah Kecamatan Jambi Luar Kota Kabupaten Batanghari. Seiring dengan perjalanan waktu dan perkembangan zaman, pada tahun 1999 Kabupaten Batanghari dimekarkan menjadi dua Kabupaten, yaitu Kabupaten Batanghari dan Kabupaten Muaro Jambi dan Desa Sebapo termasuk salah satu Desa yang berada di wilayah Kabupaten Muaro Jambi Kecamatan Mestong.

Para Pejabat Kepala Desa Sebapo semenjak berdirinya Desa Sebapo adalah sebagai berikut: